Вскоре приходят сведения, которые объясняют интерес немцев. Опасаясь советского наступления, они собираются демонтировать урановый котёл в харьковском физико-техническом институте и вывезти его в Германию. Ковальчук предлагает сыграть на фигуре Шубникова, чтобы проникнуть в институт и сорвать этот вывоз. В четырёх сериях история военной контрразведки. Ставкой в противостоянии разведок здесь становятся атомные исследования, а ключом к операции оказывается человек, на которого прежде никто не обращал внимания. Лейтенанту приходится строить расчёт на учёном, который однажды уже ушёл вместе с немецким коллегой.

Немецкое командование от бумаг не отказывается. По поручению Гиммлера Отто Скорцени готовит новый отряд специально обученных бойцов: им нужно освободить Нойбера и вывезти спрятанные документы в Германию. Против диверсантов работают сотрудники армейской контрразведки «Смерш», среди них старший лейтенант Андрей Терехов (Павел Трубинер). «Лисья нора» входит в цикл военных детективов «Смерть шпионам», но рассказывает отдельную историю.

Охота идёт сразу с трёх сторон: Змея ищут Интерпол, ФСБ и обманутые им торговцы оружием из Албании. В ФСБ к тому же выясняют, что несколько лет назад Змей украл секретные документы об уязвимых местах в безопасности государства и теперь собирается их продать. Хромова мучает вопрос, кто же на самом деле этот Змей, а Артёму, чтобы вернуть себе имя, приходится выживать в огромном городе без денег, машины и документов. Двух героев с одним лицом играет один актёр, Алексей Чадов. По словам режиссёра Степана Коршунова, у Змея голос ниже и спокойнее, а у Артёма речь быстрее и энергичнее.

Очевидцы вызывают милицию, и друзья быстро понимают, что главными подозреваемыми станут они, а в неизвестного стрелка никто не поверит. Они скрываются с места преступления и решают сами найти убийцу. Разговор с вдовой Карасёва не складывается: она выставляет Веснина и Попова за дверь, а вскоре убийца добирается и до неё. Поп и Весна едва отбиваются от хулиганов в ночном клубе и понимают, что следующими в этой кровавой цепочке могут стать они сами. Птица тем временем оказывается в СИЗО у следователя. Бежали они вместе, но теперь двое ведут расследование на воле, а третий сидит за решёткой.

Бекетов решает остаться. Первая его цель найти убийц друга, но на этом он не останавливается и, став инспектором рыбоохраны, бросает вызов всей икорной мафии. Лобанов успел предупредить, что откровенничать с ним рыбаки не станут. Повязаны все, работы нет, и выживать здесь приходится в обход закона. Стукачи водятся по обе стороны, а разоблачённых «своих» браконьеры казнят показательно, так что каждый, кто заговорит с инспектором, рискует головой. Андрей поселяется в пустующем доме, хозяин которого сидит в тюрьме, в помощницы ему назначают Татьяну. Объезжая участок, они натыкаются на браконьеров. На первый раз Бекетов хочет обойтись конфискацией самолова, но те ведут себя агрессивно и затевают драку.

Во втором сезоне бывший оперативник Андрей Бекетов, ставший рыбинспектором, обживается в Бахметьевке и ближе знакомится с её жителями. Икра здесь товар ценный и дорогой, на реке и в районе кипят нешуточные страсти, и Бекетов наводит на вверенном ему участке жёсткий порядок. Как и прежде, сезон складывается из отдельных историй по две серии.

Первая начинается с задержания: вместе с инспектором Иваном Гущиным Бекетов берёт с поличным браконьера Кузнецова, и тот в бешенстве обещает убить Гущина. Вскоре инспектора действительно убивают, но делает это Артём, сын полковника Астапова, заместителя начальника местного ГУВД. Пока отец ничего не знает, расследование идёт по всем правилам. Узнав правду, полковник понимает, что на кону его карьера и честное имя. Он отправляет сына в деревню к Бекетову и начинает заметать следы.

Для десантников начинается настоящая охота. Двух девушек-танцовщиц бандиты снова берут в плен, а под видом модельного агентства заманивают новых. За бандой стоит крупная отлаженная структура, которая торгует людьми и продаёт девушек в сексуальное рабство. Помощи ждать неоткуда: с одной стороны банда, с другой продажные сотрудники милиции и УБОПа, и друзьям остаётся ввязаться в схватку и начать собственное расследование. По их следу идут головорезы во главе с Макаром, с которым троица когда-то служила.

Второй сезон открывается похоронами: Костя разбился на мотоцикле, и Макар, Лёня и Серёга снова собираются вместе. Здесь же они знакомятся с Алексом, младшим братом погибшего, и он занимает место Кости в строю братанов.

На кладбище друзья не могут пройти мимо детей-попрошаек, над которыми издеваются бандиты. Выясняется, что брат и сестра работают на мафию: их заставляют просить милостыню и отбирают все заработанные деньги. Братаны хотят отвести детей в милицию, но те сбегают. Тогда Макар с друзьями и девушкой, инспектором по делам несовершеннолетних, берутся искать «нищенскую» мафию. Тем временем Мила, телохранитель и верный человек Царя, встречается с криминальным авторитетом по кличке Горб и просит его подготовить группу беспризорников для продажи за рубеж. В первом сезоне братаны столкнулись с торговцами девушками, теперь товаром для преступников становятся дети.

Рощин служит в отряде с особыми полномочиями при Генштабе. Кроме него, в группе ещё один профессиональный военный, Темур Чиковани, компьютерный гений Семён Пашкевич и врач Пётр Михальченко. Командует ими подполковник Сметанников, курирует генерал Могутин. Отряд должен хранить военную тайну, раскрывать самые жестокие преступления и почти в одиночку противостоять шпионской организации, которая проникла в высшие эшелоны власти. С ФСБ у военных отношения непростые. В первом деле взаимное недоверие ведомств тормозит расследование, а в Северобалтийске Рощин узнаёт, что пятым членом команды стала Ирина Старостина, уволившаяся из ФСБ.

Перевести дух «Нерпы» не успевают. В первой же истории диверсанты захватывают заложников в здании калининградского телецентра и требуют выдать им гениальную девушку-хакера по прозвищу Лиса и 10 миллионов евро. Переговоры ведёт Багира, а вместо настоящей Лисы к захватчикам отправляется девушка из отряда, удивительно на неё похожая. Сериал собран из двенадцати двухсерийных историй, и у каждой своя операция и свой противник. Во второй Бизону поручают сыграть диверсанта и проверить, насколько надёжно защищён секретный институт Министерства обороны, где уже готов опытный образец прицела нового поколения, за которым охотятся разведки Запада. Сюжеты привязаны к современной геополитике и международным конфликтам, в том числе в информационной среде, а служить отряду выпало в самой западной точке России.

Сквозной конфликт сериала связан с «Пандорой», против которой работает российский Контртеррористический центр. Вывеска международного информационно-исследовательского центра прикрывает влиятельные западные спецслужбы, которые ведут против России борьбу в политике, экономике и информационном поле. Сериал складывается из двухсерийных историй, и у каждой своя точка на карте. Уже во второй истории «акулы» отправляются в ближневосточную страну, где идёт междоусобная война и нашли месторождение родия. За право на разработку соперничают крупные державы, американцы из «Пандоры» получают задание сорвать переговоры, а бойцам вдобавок нужно найти и спасти сына шейха, который стал разменной фигурой в этом торге. Название объясняет размах: работать отряду предстоит и на дальних рубежах страны, и за её пределами.

Дальше герои остаются в лесу без организаторов, без связи и без правил, под которыми подписывались. Каждое решение о еде, огне и о том, кому верить, стоит намного дороже, чем очки в телешоу, а роль ведущего, которую все принимали за условность, вдруг становится вопросом жизни. Часть участников играют известные актёры под своими именами, и это работает на неприятное правдоподобие: на экране будто обычная съёмка, которая свернула не туда. Слоган у проекта честный, «Не для слабонервных», и он относится и к натуре, и к тому, как быстро договорённости между незнакомыми людьми перестают действовать.